Mac標準アプリの1つ「プレビュー（Preview.app）」には、ブックマーク機能があります。
この機能は、OS X Marvericksでも残っているのですが、アクセス方法が変わっています。
Mountain Lionでは、メニューに「ブックマーク」があって、そこから「ブックマークを追加」ができたのですが、Marvericksでは「ブックマーク」メニューが無くなりました。
ブックマークを追加するには、「ツール」メニューから、「ブックマークを追加」をクリックします。
また、ショートカットは以前と変わっていないので、Cmd + Dでも追加できます。
既存のブックマークは、「表示」メニューの「ブックマーク」をクリックすると表示されるサイドバーで確認できます。